Tusnády

Januárban jelent meg Dr. Tusnády Gábor kutatócsoportjának tudományos közleménye a transzmembrán fehérjék UNIfied adatbázisáról (UniTmp), amely a transzmembrán fehérjék szerkezeti információinak átfogó és szabadon hozzáférhető forrása, a fehérjeszegmensek lokalizációjától a fehérje topológiáján keresztül a membránba ágyazott 3D szerkezetig. A kutatók az adatbázisba nemcsak több tízezer új struktúrát és kísérletet annotáltak, hanem egy új rendszert is kifejlesztettek, amely párhuzamosan képes kiszolgálni ezeket a forrásokat. Az UniTmp egy olyan platform, amely egyesíti a TOPDB (Topology Data Bank of Transmembrane Proteins), a TOPDOM (a fehérjékben található konzervatív domének és motívumok adatbázisa), a PDBTM (Protein Data Bank of Transmembrane Proteins) és a HTP (Human Transmembrane Proteome) adatbázisokat, és interoperabilitást biztosít a beépített erőforrások között, valamint egyszerű módot a rendszeres frissítésükhöz. A jelenlegi frissítés 9235 membránba ágyazott struktúrát, 9088 szekvenciát tartalmaz 536 035 topológiailag annotált szegmenssel és 8692 konzervatívan lokalizált fehérje doménnel vagy motívummal, valamint 5466 annotált humán transzmembrán fehérjét. Az UniTmp adatbázis a https://www.unitmp.org címen érhető el.

A cikk teljes terjedelmében itt olvasható.