Adatbázis-szolgáltatások

Akronim: HTP

Leírás: Emberi transzmembrán proteóm adatbázisa

Webcím: http://htp.enzim.hu

Referencia: Dobson, L., Reményi, I., Tusnády, G.E., 2015b. The human transmembrane proteome. Biol Direct 10, 31. https://doi.org/10.1186/s13062-015-0061-x

Akronim: PDBTM

Leírás: Meghatározott térszerkezettel rendelkező transzmembrán fehérjék membrán lokalizációjának adatbázisa

Webcím: http://pdbtm.enzim.hu

Referencia: Kozma, D., Simon, I., Tusnády, G.E., 2013. PDBTM: Protein Data Bank of transmembrane proteins after 8 years. Nucleic Acids Res 41, D524-529. https://doi.org/10.1093/nar/gks1169

Akronim: PolarProtDb

Leírás: Polarizált sejtekben levő transzmembrán fehérjék lokalizációjának és poszt-transzlációs módosulásainak adatbázisa

Webcím: http://polarprotdb.ttk.hu/

Referencia: Zeke, A., Dobson, L., Szekeres, L.I., Langó, T., Tusnády, G.E., 2021. PolarProtDb: A Database of Transmembrane and Secreted Proteins showing Apical-Basal Polarity. J Mol Biol 433, 166705. https://doi.org/10.1016/j.jmb.2020.11.004

Akronim:TmAlphaFold

Leírás: AlphaFold2 eljárás által becsült transzmembránfehérje szerkezetek membrán-lokalizációjának adatbázisa

Webcím: https://tmalphafold.ttk.hu/

Referencia: Dobson, L., Szekeres, L.I., Gerdán, C., Langó, T., Zeke, A., Tusnády, G.E., 2023. TmAlphaFold database: membrane localization and evaluation of AlphaFold2 predicted alpha-helical transmembrane protein structures. Nucleic Acids Res 51, D517–D522. https://doi.org/10.1093/nar/gkac928

Akronim: ChIPSummitDB 

Leírás: A ChIPSummitDB a humán ChIP-seq kísérletekkel igazolt transzkripciós faktor kötőhelyek átfogó adatbázisa.

Webcím: https://summit.med.unideb.hu/summitdb/

Referencia: Czipa, E., Schiller, M., Nagy, T., Kontra, L., Steiner, L., Koller, J., Pálné-Szén, O., Barta, E., 2020. ChIPSummitDB: a ChIP-seq-based database of human transcription factor binding sites and the topological arrangements of the proteins bound to them. Database (Oxford) 2020, baz141. https://doi.org/10.1093/database/baz141

Akronim: TOPDB

Leírás: Transzmembrán fehérjék kísérleti úton meghatározott topológiai adatainak adatbázisa

Webcím: http://topdb.enzim.hu

Referencia: Dobson, L., Langó, T., Reményi, I., Tusnády, G.E., 2015a. Expediting topology data gathering for the TOPDB database. Nucleic Acids Res 43, D283-289. https://doi.org/10.1093/nar/gku1119

Akronim: TFLink

Leírás: Transzkripciós faktor - célgén interakciós és kötőhely adatbázis több fajra

Webcím: https://tflink.net/

Referencia: Liska, O., Bohár, B., Hidas, A., Korcsmáros, T., Papp, B., Fazekas, D., Ari, E., 2022. TFLink: an integrated gateway to access transcription factor-target gene interactions for multiple species. Database (Oxford) 2022, baac083. https://doi.org/10.1093/database/baac083

Akronim: TSTMP

Leírás: Legfontosabb transzmembrán célfehérjék adatbázisa

Webcím: http://tstmp.enzim.ttk.mta.hu

Referencia: Varga, J., Dobson, L., Reményi, I., Tusnády, G.E., 2017. TSTMP: target selection for structural genomics of human transmembrane proteins. Nucleic Acids Res 45, D325–D330. https://doi.org/10.1093/nar/gkw939

Akronim: NRR, Nemzeti Rákregiszter

Leírás: A különböző rákos megbetegedések számait tartalmazza nemi, korcsoportos és terület szerinti bontásban.

Webcím: https://onkol.hu/nemzeti-rakregiszter/

Referencia: Kenessey I, Wéber A, Szilágyi I, Nagy P, Polgár C, Kásler M. Az orvosi kódtárak gyakorlati alkalmazása az onkológiában – szakmai útmutató a Nemzeti Rákregiszter tapasztalatai alapján. Magy Onkol. 2022 Mar 28;66(1):4-10. Hungarian. Epub 2021 Dec 18. PMID: 35343969.

Akronim: MÉTA

Leírás: A hazai természetes növényzeti örökségünk tudományos értékelésére szolgáló program

Webcím: https://www.novenyzetiterkep.hu/

Referencia: Somodi, I., Molnár, Z., Czúcz, B., Bede‐Fazekas, Á., Bölöni, J., Pásztor, L., Laborczi, A., Zimmermann, N.E., 2017. Implementation and application of multiple potential natural vegetation models – a case study of Hungary. J Veg Sci 28, 1260–1269. https://doi.org/10.1111/jvs.12564