MABIT

A HUN-REN Természettudományi Kutatóközpont Nagytermében került megrendezésre november 8-án a 2024-es MABIT konferencia. Az esemény fő szervezője idén is Dr. Tusnády Gábor ELIXIR Vezető kutató volt; a rendezvényt Prof. Dr. Pongor Sándor ELIXIR Vezető kutató nyitotta meg. A szekciók vezetésére többek között Prof. Dr. Győrffy Balázs ELIXIR Csomópont Vezető és Dr. Ari Eszter ELIXIR Vezető kutató kaptak felkérést.

A konferencia négy szekciója a bioinformatikai algoritmusok, a rendszerbiológia, a szerkezeti bioinformatika és az orvosi bioinformatika legfontosabb kérdéseit járta körbe. Megismerhettük az archeogenomika, a gombák genomikája és evolúciója, valamint a többféle ontológiát és empirikus FDR-t alkalmazó dúsulást vizsgáló R csomag legújabb eredményeit. Emellett betekintést nyerhettünk a filogenetikai fák metszésének, a pángenom és assembly gráfok valószínűség alapú vizsgálatának, valamint a génexpresszió előrejelzésének innovatív megközelítéseibe.

A MABIT 2024 konferencia idén is a hazai bioinformatikai közösség kiemelkedő eseménye volt. A rendezvény programja változatos és izgalmas előadásokkal várta a résztvevőket, amelyek a legfrissebb kutatási eredményeket és innovatív megoldásokat mutattak be. A részletes program alább olvasható, az előadások absztraktjait pedig a MABIT honlapjáról lehet letölteni.

1. SZEKCIÓ – BIOINFORMATIKAI ALGORITMUSOK 1.

Elnök: Dr. Ari Eszter

10:00 - 10:05: Köszöntő Prof. Dr. Pongor Sándor

 

10:05 - 10:20: Bioinformatikai alkalmazások és kihívások az archeogenomikában

Gerber Dániel (MTA-BTK Lendület Biorégészet Kutatócsoport; HUN-REN BTK Archeogenomikai Intézet)

10:20 - 10:35: Annotált genomok szennyeződéseinek érzékeny kimutatása és eltávolítása a ContScout programmal

Bálint Balázs (HUN-REN SZBK Biokémiai Intézet, Gomba Genomika és Evolúció Csoport)

10:35 - 10:50: mulea - egy többféle ontológiát és empirikus FDR-t alkalmazó dúsulást vizsgáló R csomag

Dr. Ari Eszter (HUN-REN Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Biokémiai Intézet; Eötvös Loránd Tudományegyetem, Genetikai Tanszék)

10:50 - 11:05: Filogenetikai fák metszése

Hegedűs Dániel és Juhász Márk Hunor (ELTE TTK, Matematikai Intézet; ELTE TTK, Biológiai Intézet, Genetika Tanszék)

11:05 - 11:20: Nukleotid szekvenciák kontextusának vizsgálata pángenom és assembly gráfokban valószínűség alapú módszerekkel

Juhász Judit (Pázmány Péter Katolikus Egyetem, Információs Technológiai és Bionikai Kar)

 

11:20 - 11:35: Szünet 

 

2. SZEKCIÓ – BIOINFORMATIKAI ALGORITMUSOK 2.

Elnök: Dr. Hegedűs Tamás

11:35 - 11:50: Génexpresszió előrejelzése Escherichia coli baktériumban genomikai nyelvmodellek segítségével

Krizsán Dániel (Pázmány Péter Katolikus Egyetem, Információs Technológiai és Bionikai Kar)

11:50 - 12:05: Agyhullámok és Mentális Zavarok: A Legkorábbi Jelek Feltárása 

Nagy Ádám (Szegedi Tudományegyetem, Szoftverfejlesztési Tanszék)

12:05 - 12:20: Metabolit-betegség asszociációk becslése hiperbolikus terekben 

Pogány Domonkos (BME Mesterséges Intelligencia és Rendszertervezés Tanszéken, Mesterséges Intelligencia Kutatócsoport)

12:20 - 12:35: Jellemzők terének szűrése utranagy dimenziójú többosztályos adatokon

Stippinger Marcell (HUN-REN Wigner Fizikai Kutatóközpont, Részecske- és Magfizikai Intézet, Komputációs Tudományok Osztálya)

12:35 - 12:50: Nyílt forráskódú vírusgenom-összeszerelő pipeline-ok összehasonlító elemzése

Zsichla Levente (Biológiai Intézet, Eötvös Loránd Tudományegyetem; Egészségbiztonság Nemzeti Laboratórium, Eötvös Loránd Tudományegyetem)

 

12:50 - 13:30: Szünet

 

3. Szekció - RENDSZERBIOLÓGIA, SZERKEZETI BIOINFORMATIKA, ORVOSI BIOINFORMATIKA

Elnök: Dr. Kerepesi Csaba

13:30 - 13:45: Poszt-perturbációs génexpressziót prediktáló gépi tanulási modellek kiértékelése

Csendes Gerold (Turbine Kft)

13:45 - 14:00: Hogyan fedez fel egy sejtszimuláció új fehérjekomplexeket?

Weber Áron (Cytocast Hungary Kft; Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar)

14:00 - 14:15: Új szimulációs keretrendszer multivalens fehérjék és membránfehérjék közötti kötődés vizsgálatára

Bruncsis Bence (BME Mesterséges Intelligencia és Rendszertervezés Tanszéken, Mesterséges Intelligencia Kutatócsoport)

14:15 - 14:30: Kölcsönhatások elemzése a PSD-ben: a GKAP-LC8 példája

Kálmán Zsófia (Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar)

14:30 - 14:45: Klinikai megfontolások az antimikrobiális rezisztenciapotenciálhoz

Tóth Adrienn Gréta (Bioinformatikai központ, Állatorvostudományi Egyetem)

14:45 - 15:00: Metagenomikai bepillantás egy gabonamúmiába

Nagy Sára (Komplex rendszerek fizikája tanszék, Eötvös Loránd Tudományegyetem)

 

15:00 - 15:15: Szünet

 

4. SZEKCIÓ – ORVOSI BIOINFORMATIKA

Elnök: Prof. Dr. Győrffy Balázs

15:15 - 15:30: Genomi monitoring és fágterápia összekapcsolása az antibiotikum-rezisztens kórokozók elleni küzdelemben

Stirling Tamás (HUN-REN Szegedi Biológiai Kutatóközpont; Szegedi Tudományegyetem, Biológia Doktori Iskola)

15:30 - 15:45: Továbbfejlesztett ROCKET algoritmus tónusos-klónusos  epilepsziás rohamok felismerésére

Dr. Buza Krisztián (Sapientia Erdélyi Magyar Tudományegyetem, Matematika-Informatika Tanszék, Biointelligencia Kutatócsoport; Budapesti Gazdasági Egyetem, Gazdaságinformatika Tanszék)

15:45 - 16:00: A sport hatása a biológiai életkor változására

Szatmári Zita Eszter (HUN-REN Számítástechnikai és Automatizálási Kutatóintézet)

16:00 - 16:15: A legújabb öregedés órák és érdekes alkalmazásaik

Dr. Kerepesi Csaba (HUN-REN Számítástechnikai és Automatizálási Kutatóintézet)

16:15 - 16:30: Epigenetikai altípusok és génszintű metilációs változások vizsgálata vastagbél adenokarcinómában

Müller Dalma (Semmelweis Egyetem, Bioinformatika Tanszék)

16:30 - 16:45: A makrofág promóterek összetételének vizsgálata

Dr. Nagy Gergely (Debreceni Egyetem, Általános Orvostudományi Kar, Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet)

16:45 - 16:50: Zárszó Prof. Dr. Győrffy Balázs