Dr. Szász Attila Marcell ELIXIR Vezető kutató társszerzőségével közlemény jelent meg a Journal of Proteomics nevű nemzetközi folyóiratban idén júliusban. A kutatócsoport olyan módszert fejlesztett ki, amely a digitális patológiát, proteomikát és mesterséges intelligenciát ötvözi a rák pontosabb diagnosztizálására. A hagyományos mikroszkópos vizsgálatok helyett nagy felbontású digitális képeket készítenek a szövetmintákról, amelyeket AI algoritmusok elemeznek.
A valódi áttörést az jelenti, hogy a digitális képelemzést kombinálják a proteomikával - lézeres mikroszkóppal pontosan kivágják a szövet érdekes részeit, majd tömegspektrométerrel elemzik a fehérje-összetételt. Ez több ezer fehérje egyidejű mérését teszi lehetővé, olyan molekuláris térképet adva, amely a hagyományos módszerekkel elérhetetlen volt. A bioinformatikai feldolgozás során gépi tanulás algoritmusok (UMAP, t-SNE, neurális hálózatok) kapcsolják össze a morfológiai és molekuláris adatokat. Melanoma kutatásban tesztelve a módszer olyan molekuláris aláírásokat azonosított, amelyek előre jelzik a betegség kiújulását. A mitokondriumok és immunválasz útvonalaiban bekövetkezett változások kulcsszerepet játszanak a melanoma visszatérésében.
Ez az integratív megközelítés személyre szabott rákkezelést ígér, ahol minden beteg egyedi molekuláris profil alapján kap terápiát, jelentősen javítva a gyógyulási esélyeket.
A cikk teljes terjedelmében ezen a linken olvasható.
