Bioinformatikai tanulmányi verseny kiírás

A Semmelweis Egyetem Bioinformatika Tanszéke tanulmányi versenyt hirdet egy bioinformatikai probléma megoldására

A verseny során a cél a taxán (paclitaxel és docetaxel) tartalmú terápiát előre jelezni képes génexpressziós mintázat azonosítása rosszindulatú tumoros sejtvonalakban. A feladathoz tartozó adatbázis a tumoros sejtvonalak génexpressziós adatait, a terápia kimenetét (terápia rezisztens / terápia szenzitív) tartalmazza.  

Az alkalmazott megoldás, illetve eszközök lehetnek:

• tetszőleges statisztikai módszer vagy mesterséges intelligencia algoritmus
• MS Excel /SPSS
• Galaxy platform
• R statisztikai programcsomagok
• Python

Jelentkezés:

A jelentkezés e-mailben történik név és NEPTUN-kód elküldésével a bioinformatika@med.semmelweis-univ.hu címre. A jelentkezők a bemeneti adatokat e-mailben kapják meg.

Jelentkezési határidő: 2023. 02. 28.

A beadott munkának tartalmaznia kell:

• a megoldás forráskódja vagy algoritmusa
• szöveges dokumentáció (maximum három A4-es oldal)

Beadási határidő: 2023.04.30.

Eredményhirdetés: 2023. május 15.

Értékelés:
A beküldött megoldások rangsorolása a beküldött szöveges dokumentáció minősége és a forráskód reprodukálhatósága alapján történik.

Díjak:

1. hely: nemzetközi bioinformatikai továbbképzésen vagy konferencián való részvétel.
2. hely: hazai bioinformatikai továbbképzésen vagy konferencián való részvétel.

• Az első helyezett nemzetközi (Európai Unió), a második helyezett hazai bioinformatikai kurzust az Elixir Europe illetve Elixir Magyarország honlapjáról választhat:
  • https://tess.elixir-europe.org/events
  • https://www.bioinformatics.hu/
• A választott kurzus időtartama maximum 6 nap lehet. 
• A nyeremény fedezi a regisztrációs díjat, valamint személyes részvétel esetén az utazás és a szállás költségét. (A választott szálloda maximum háromcsillagos.)

1. Az 1-3. helyezettek a Klinikai Bioinformatika tárgy felvétele esetén megajánlott jeles gyakorlati jegyet kapnak.

Minden versenyzőnek sikeres munkát kívánunk!                                                                  

Prof. Dr. Győrffy Balázs és Dr. Fekete János Tibor

 

Kapcsolat: 

Dr. Fekete János Tibor                                                                                                    

email:  fekete.janos@med.semmelweis-univ.hu     

tel.: +36 20 770 0513