Dr. Ari Eszter
HUN-REN, Szegedi Biológiai Kutatóközpont, Biokémiai Intézet, Szeged
Eötvös Loránd Tudományegyetem, TTK Biológiai Intézet, Budapest
Kutatási területek: evolúcióbiológia, genomika, bioinformatika
Csoportunk többféle evolúcióbiológiai, genomikai, bioinformatikai kutatást végez: Vizsgáljuk a baktériumokban található mobilis antibiotikum rezisztenciagének és a patogenitást okozó virulencia gének mobilitásának összefüggéseit. Létrehoztuk a TLink adatbázist, amely átfogó és pontos információkkal látja el a kutatókat a transzkripciós faktor - célgén interakciókról, a transzkripciós faktor kötőhelyek nukleotid szekvenciájáról és azok genomi elhelyezkedéséről az ember és hat fő model organizmus tekintetében. A hazai SARS-CoV-2 vírusgenomokat a világ más országaiban izolált vírusváltozatokhoz hasonlítottuk, és evolúciós törzsfát építettünkünk, melynek segítségével kideríthető az egyes hullámok időbeli és térbeli eredete. Fejlesztjük a mulea (multi enrichment analysis) és a muleaData R csomagokat, melyek segítségével sokoldalú funkcionális dúsulási analíziseket végezhet a felhasználó.
2022-2023-ban D1-es v Q1-es rangú újságban cikkek:
- Gerber D, Szeifert B, Székely O, Egyed B, Gyuris B, Giblin JI, Horváth A, Köhler K, Kulcsár G, Kustár Á, Major I, Molnár M, Palcsu L, Szeverényi V, Fábián S, Mende BG, Bondár M, Ari E*, Kiss V*, Szécsényi-Nagy A* (2023) Interdisciplinary analyses of Bronze Age communities from Western Hungary reveal complex population histories. Molecular Biology and Evolution, msad182 (preprint: bioRxiv, 2022, 10.1101/2022.02.03.478968) D1, IF: 10.7, IC: 1 (*megosztott levelező szerző)
- Sturm Á, Saskői É, Hotzi B, Tarnóci A, Barna J, Bodnár F, Sharma H, Kovács T, Ari E, Weinhardt N, Kerepesi C, Perczel A, Ivics Z, Vellai T (2023) Downregulation of transposable elements extends lifespan in Caenorhabditis elegans. Nature Communications, 14(1): 5278. D1, IF: 16.6
- Bacsur P, Rutka M, Resál T, Szántó K, Jójárt B, Bálint A, Ari E, Walliyulah A, Kintses B, Fehér T, Asbóth A, Pigniczki D, Bor R, Fábián A, Maléth J, Szepes Z, Farkas K, Molnár T (2023) Effects of bowel cleansing on the composition of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients and healthy controls. Therapeutic Advances in Gastroenterology, 16: 1-13. Q1, IF: 4.2, IC: 1
- Ari E, Vásárhelyi BM, Kemenesi G, Tóth GE, Zana B, Somogyi B, Lanszki Z, Röst G, Jakab F, Papp B, Kintses B (2022) A single early introduction governed viral diversity in the second wave of SARS-CoV-2 epidemic in Hungary. Virus Evolution, 8(2): veac069. D1, IF: 5.3, IC: 1
- Csabai L*, Fazekas D*, Kadlecsik T*, Szalay-Bekő M, Bohár B, Madgwick M, Módos D, Ölbei M, Gul L, Sudhakar P, Kubisch J, Oyeyemi OJ, Liska O, Ari E, Hotzi B, Billes VA, Molnár E, Földvári-Nagy L, Csályi K, Demeter A, Pápai N, Koltai M, Varga M, Lenti K, Farkas IJ, Türei D, Csermely P, Vellai T, Korcsmáros T (2022) SignaLink3: A multi-layered resource to uncover tissue-specific signaling networks. Nucleic Acids Research, 50(D1): gkab909. D1, IF: 14.9, IC: 14
- Liska O, Bohár B, Hidas H, Korcsmáros T, Papp B, Fazekas D, Ari E* (2022) TFLink: An integrated gateway to access transcription factor - target gene interactions for multiple species. Database, baac083. D1, IF: 5.8, IC: 14 (*levelező szerző)
